Données biologiques

PAGE EN COURS DE REDACTION

Lors des différentes enquêtes menées auprès des familles Elfe, certaines sont complétées par des recueils biologiques sur un sous‑échantillon de volontaires (auprès de la mère en maternité, auprès de l’enfant à la naissance et lors de ses premières années de vie) pour tester l’impact de différents facteurs (environnementaux, nutritionnels, infectieux, hormonaux…) sur l’état de santé et sur le développement physique et moteur des enfants.

Certains projets reposent sur l’utilisation d’échantillons prélevés au cours des différentes étapes du suivi de la cohorte. Certaines analyses ou dosages ont déjà été réalisés sur certains de ces prélèvements. Comme pour les bases thématiques, les résultats de ces analyses sont mis à disposition de la communauté scientifique sous forme de bases appariables à votre panier de données Elfe. Vous trouverez ci-dessous des informations relatives aux types de prélèvements analysés et aux mesures réalisées. La documentation précise des variables disponibles dans chacune de ces bases est décrite dans un document séparé. 
 

Résumé des résultats biologiques

Résultats biologiques par enquête
Fichier des dosages biologiques Elfe par enquête

Résultats biologiques par type de biomarqueurs / polluants
Fichier des dosages biologiques Elfe par type de biomarqueurs / polluants

Documentation des résultats biologiques

EQRB1 : Imprégnation des femmes enceintes par les polluants de l’environnement

Volet périnatal du programme national de biosurveillance mis en œuvre au sein de la cohorte Elfe. 

Dans le cadre du volet périnatal, 2 006 femmes enceintes ont fait l’objet d’au moins un dosage de biomarqueurs d’exposition à des polluants organiques. Chacun des biomarqueurs ayant pu être mesurés sur un échantillon d’environ 1000 femmes. Ont été mesurés : 

• L’imprégnation des femmes enceintes par les polluants organiques : bisphénol A, phtalates, pesticides et polluants organiques persistants (dioxines, furanes, PCB, retardateurs de flamme et composés perfluorés) [doc de l'EQRB1 Tome 1 : polluants organiques].
   
• L’imprégnation des femmes enceintes par les métaux et métalloïdes (antimoine, arsenic, cadmium, césium, chrome, cobalt, étain, mercure, nickel, plomb, uranium, vanadium) [doc de l'EQRB1 Tome 2 : métaux et métalloïdes].

Pour obtenir les bases de données de ces dosages, merci de préciser dans votre demande le (ou les) type de dosages souhaité parmi en utilisant les fichiers Dosage biologiques par enquête ou Dosage biologiques par substance (exemple : EQRB1KM pour carbamates).

EQRB2 : Mesures de pesticides et métabolites dans les cheveux des mères Elfe pendant la grossesse

Rémi Béranger, Cécile Chevrier, Brice Appenzeller - LIH (Brice Appenzeller) et Irset – UMR_S 1085 (R. Béranger & C. Chevrier).

140 pesticides et métabolites ont été détectés dans les cheveux de 311 mères de la cohorte Elfe (mesures disponibles représentant une « moyenne » sur la grossesse ». Pour 47 d’entre elles (avec 3 échantillons de 3 cm), la mesure a pu être réalisée 3 fois. Pour ces 47 femmes, les données sont donc également disponibles par trimestre de grossesse [doc de l'EQRB2].

EQRB3 : Mesures des composés chimiques présents dans les cheveux des mères pendant la grossesse et dans les cheveux des enfants à 3,5 ans

Zohra Chupeau, Philippe Glorennec, Cécile Chevrier, Fabien Mercier.

L’objectif premier des dosages est de permettre une description des concentrations en composés chimiques (OPFR, PBDE et PCB) présents dans les cheveux des mamans pendant la grossesse et dans les cheveux des enfants à 3,5 ans. Ces concentrations sont des marqueurs de l’exposition à ces composés chimiques de la maman pendant la grossesse et de l’enfant au cours de ces premières années de vie, et ont été mesuré sur 395 Mères et 262 enfants [doc de l'EQRB3].

EQRB4 : Mesure de cortisol et cortisone dans les cheveux Mères pendant la grossesse par trimestre grossesse

Judith van der Waerden, Equipe de recherche en épidémiologie sociale (ERES) Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique - U_1136 INSERM & Sorbonne Université.

844 échantillons de cheveux maternels ont été envoyés pour analyse. Selon la longueur des cheveux analysées, les mesures de cortisol et de cortisone ont pu être réalisées sur 565 à 834 femmes (données disponibles pour chaque trimestre de grossesse) [doc de l'EQRB4].

EQRB5 : Mesure des cytokines dans le sérum

Laetitia Davidovic, Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire. CNRS UMR 7275.

Les concentrations de 30 cytokines ont été mesurées à l’aide de cinq tests immunologiques sur 1024 échantillons de sérum de sang de cordon (2020-10-06 Elfe dosages All Cytokines CBS.docx), et 11 cytokines sur 1028 sérums maternels (2020-10-06 Elfe dosages All Cytokines MS). La concentration de BDNF (Brain Derived Neurotrophic factor) a également été mesuré sur ces 1024 échantillons de sérum de sang de cordon (2020-10-06 Elfe dosages BDNF CBS.docx) et sur 1019 sérums maternels (2020-10-06 Elfe dosages All Cytokines MS.docx).

EQRB6 : Analyse du microbiote intestinal par séquençage du gène codant l’ARNr 16S dans les méconiums

C. Cherbuy, INRAE, UMR MICALIS, Jouy-en-Josas ; K  Adel-Patient, INRAE, UMR MTS – Saclay ; B de Lauzon-Guillain, INSERM CRESS équipe EAROH.

L'ADN génomique de 474 échantillons des méconiums a été extrait à l'aide du kit QIAamp PowerFecal Pro DNA (Qiagen, Allemagne), la région hypervariable V3-V4 du gène de l'ARNr 16S a été amplifiée par PCR et finalement e séquençage par méthode Miseq a été réalisé par la plateforme @Bridge labélisée ISO 9001 (https://abridge.inrae.fr) [DOC EQRB6 Analyse_Microbiote_ELFE.docx].

EQRB7 : Analyse de la communauté microbienne intestinale à partir d'échantillons fécaux d'enfants âgés de 3,5 ans, en utilisant le séquençage du gène d'ARN ribosomal 16S avec MiSeq (Illumina)

Gael Toubon et Marie-Aline Charles, MD, PhD CRESS UMR1153, Julio Aires, PhD 3PHM UMR-S 1139.

L'ADN fécal de 630 échantillons a été extrait selon la procédure opérationnelle standard 7 des Normes Internationales sur le Microbiome Humain (https://human-microbiome.org/index.php?id=Sop&num=007). Le séquençage a été effectué en utilisant la technologie Illumina Miseq ciblant les amorces V3-V4 des régions de l'ARNr bactérien 16S. doc microbiote (lien : 10_2023_ELFE_documentation_variables_biologiques_microbiote).

EQRB8 : Analyse de la méthylation d’ADN

Fabien Delahaye, PhD. EGID / Institut Pasteur de Lille UMR1283/8199.

Les données relatives au Génotypage et à la méthylation de 147 échantillons d'ADN isolés de sang de cordon ont été générées à l'aide du micro-array Illumina MethylationEPIC BeadChip (Illumina, Inc., San Diego, CA, USA), qui couvre un total de 853.307 sites CpG. Méthylation : MM_Methylation_Epipreterm.docx.
 

Résumé des prélèvements biologiques par enquête

Ces prélèvements sont soigneusement recueillis, stockés en biobanque et peuvent être mis à disposition des chercheurs dans des conditions d’accès très règlementées. A partir de 2025, l’ensemble des échantillons biologiques prélevés soit environ 200 000 aliquots (fractions d’un échantillon) sont stockés à la Fondation Jean Dausset. 

Pour tous renseignements sur les prélèvements, leur utilisation ou leurs analyses passées : merci d'écrire à contact @ elfe-france.fr